Контрольно-счетная палата муниципального образования "Городской округ "Город Нарьян-Мар" при осуществлении своей деятельности имеет право взаимодействовать со Счетной палатой Ненецкого автономного округа, с контрольно-счетными органами других субъектов Российской Федерации, с контрольно-счетными органами муниципальных образований Ненецкого автономного округа, а также со Счетной палатой Российской Федерации, с территориальными управлениями Центрального банка, налоговыми органами, органами прокуратуры, иными правоохранительными, надзорными и контрольными органами Российской Федерации, субъектов Российской Федерации и муниципальных образований. Контрольно-счетная палата муниципального образования "Городской округ "Город Нарьян-Мар" вправе заключать с указанными органами соглашения о сотрудничестве и взаимодействии.
При осуществлении своей деятельности Контрольно-счетная палата муниципального образования "Городской округ "Город Нарьян-Мар" взаимодействует с органами Администрации муниципального образования «Городской округ «Город Нарьян-Мар», уполномоченными на осуществление муниципального финансового контроля.